Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Use1Q9CQ56 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Use1Q9CQ56 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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