Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NenfQ9CQ45 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NenfQ9CQ45 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NenfQ9CQ45 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms