Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sh3bp5lQ99LH9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms