Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms