Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfdQ925I7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms