Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdl1Q923A2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms