Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip1Q922J3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms