Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Afg3l1Q920A7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Afg3l1Q920A7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Afg3l1Q920A7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms