Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tdrd3Q91W18 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms