Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc12Q8R344 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms