Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OptnQ8K3K8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms