Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc4a8Q8JZR6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms