Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Q4Q8HWB2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms