Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms