Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dclre1bQ8C7W7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms