Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ubqln3Q8C5U9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms