Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trerf1Q8BXJ2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms