Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms