Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms