Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Smarcal1Q8BJL0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcal1Q8BJL0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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