Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco3Q8BH01 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms