Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Htatsf1Q8BGC0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms