Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms