Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Liat1Q810M6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms