Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms