Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm5bQ80Y84 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm5bQ80Y84 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms