Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc28Q80XJ3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms