Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zbed4Q80WQ9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed4Q80WQ9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms