Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmed3Q78IS1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms