Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1cQ76I25 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms