Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms