Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms