Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms