Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slx4Q6P1D7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slx4Q6P1D7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms