Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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