Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tpm4Q6IRU2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tpm4Q6IRU2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tpm4Q6IRU2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tpm4Q6IRU2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm4Q6IRU2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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