Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Jmjd1cQ69ZK6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms