Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e1Q64104 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms