Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtmQ62388 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
AtmQ62388 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms