Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd6Q61003 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd6Q61003 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd6Q61003 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cd6Q61003 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd6Q61003 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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