Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Klf3Q60980 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms