Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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