Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsr1Q5SWD9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms