Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Spire1Q52KF3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spire1Q52KF3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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