Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx25Q3ZT31 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx25Q3ZT31 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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