Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms