Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms