Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Dnah12Q3V0Q1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Dnah12Q3V0Q1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms