Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BB287469Q3UT53 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms