Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp19Q3UJD6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms